Il supercervellone del Cineca testa le cure anti covid 19

«È una collaborazione di lunga data, quella con Dompè, nata già una quindicina di anni fa per mettere a sistema competenze computazionali, conoscenze biochimiche e la più grande potenza di calcolo in Europa, grazie alla rete Hpc (High performance computing), ma l'epidemia coronavirus ha fatto esplodere la valenza di questo progetto e oggi stiamo aggregando nuovi partner privati e altri centri di supercalcolo paneuropei che ci permetteranno di accorciare ulteriormente i tempi per arrivare a identificare l’antivirale contro il Covid-19. L’obiettivo infatti è testare in tempi sempre più rapidi miliardi di nuove molecole farmacologiche e misurare l’effetto sulle proteine che consentono al virus di replicarsi».

Così David Vannozzi, direttore generale del Cineca, commenta la nuova declinazione della piattaforma intelligente contro i patogeni Exscalate, lanciata ufficialmente dalla casa farmaceutica milanese un anno fa e ora salita agli onori della cronaca nella versione “Coronavirus” (Exscalate4CoV), progetto che l’Ue ha cofinanziato con 3 milioni di euro nell’ambito del bando Horizon 2020 dedicato a progetti di ricerca su Covid-19.

Si tratta di un sistema di supercalcolo che pesca in una “biblioteca chimica” di oltre 500 miliardi di molecole e può valutare più di 3 milioni di molecole al secondo su 30 target biologici contemporaneamente, a un costo “irrisorio”: 4mila euro per lo screening di un miliardo di molecole. Il cervellone bolognese Marconi, il supercomputer per la ricerca scientifica più potente in Italia di proprietà del Cineca - il Consorzio interuniversitario no profit nato nel 1969 formato da Miur, 69 atenei italiani e 11 istituzioni pubbliche - è il protagonista tecnologico di questa corsa farmacologica contro il tempo per contenere la diffusione del virus.

«Il lavoro che stiamo portando avanti in queste settimane con Dompè è il più grande progetto di supercalcolo per la ricerca farmacologica messo in campo finora, perché coinvolge 18 tra istituzioni e centri di ricerca in 7 Paesi europei, tra cui il cervellone spagnolo Bsc di Barcellona e quello tedesco di Jülich (ma anche Università e Politecnico di Milano, Fraunhofer, Swiss Institute of Bioinformatics, Kth Royal Institute of Technology, l’Istituto nazionale per le malattie infettive Lazzaro Spallanzani, per citare alcuni nomi, ndr)» sottolinea Sanzio Bassini direttore del dipartimento supercalcolo del Cineca, che oggi ha 20 ricercatori nel quartier generale di Bologna, dei 100 che costituiscono il team di ricerca (sugli oltre 800 dipendenti totali del Consorzio).

Presto il testimone di alleato chiave per l’urgent computing passerà a Leonardo, il nuovo supercomputer pre-exascale che dal prossimo anno sarà ospitato nel Tecnopolo di Bologna, 240 milioni di euro di investimento per avere in Italia una potenza di calcolo di 270 Teraflops (mille miliardi di operazioni in virgola mobile in un secondo), uno dei primi cinque cervelloni al mondo, hub della EuroHpc Joint Undertaking, il partenariato pubblico-privato europeo che acquisirà, creerà e implementerà in tutta Europa un’infrastruttura di calcolo ad alte prestazioni per sostenere ricerca e innovazione tanto nelle università quanto nelle imprese.